README

   1 Modeling the Effects of Norepinephrine Concentration on Working Memory in the
   2 Prefrontal Cortex with a1 and a2 Receptors.
   3
   4 Python model doing the above. Part of Boston University RISE 2021.
   5
   6 Julia Tomaszewska, Armaan Bhojwani, Thalia Inui, Nitsueh Kebere, Dr.
   7 Marianne Bezaire.
   8
   9 The work in this repository was in-part derived from "Effects of Guanfacine and
  10 Phenylephrine on a Spiking Neuron Model of Working Memory" by Peter Duggins,
  11 Terry Stewart, Xuan Choo, Chris Eliasmith.
  12 <https://github.com/psipeter/drugs_and_working_memory>
  13
  14 Usage
  15 =====
  16
  17 Create and activate a new virtual environment:
  18
  19     python3 -m venv venv
  20     . ./venv/bin/activate
  21
  22 Install necesary dependencies:
  23
  24         pip install -r requirements.txt
  25
  26 Modify conf.py as needed:
  27
  28         vi conf.py
  29
  30 Run simulation:
  31
  32         python3 model.py
  33
  34 An overall progress bar is shown during the simulation, and more detailed
  35 results are stored in a log file. Logs and charts are stored in ./out/. The
  36 simulation will be skipped if a file named simulation.pkl is present. It will be
  37 loaded and used instead of the simulation being run.