]> git.armaanb.net Git - norepinephrine_wm.git/blob - README
Restructure repository
[norepinephrine_wm.git] / README
1 Modeling the Effects of Norepinephrine Concentration on Working Memory in the
2 Prefrontal Cortex with a1 and a2 Receptors.
3
4 Python model doing the above. Part of Boston University RISE 2021.
5
6 Julia Tomaszewska, Armaan Bhojwani, Thalia Inui, Nitsueh Kebere, Dr.
7 Marianne Bezaire.
8
9 The work in this repository was in-part derived from "Effects of Guanfacine and
10 Phenylephrine on a Spiking Neuron Model of Working Memory" by Peter Duggins,
11 Terry Stewart, Xuan Choo, Chris Eliasmith. Some of those original files are
12 preserved in old/.
13 <https://github.com/psipeter/drugs_and_working_memory>
14
15 Usage
16 =====
17
18 Create and activate a new virtual environment:
19
20     python3 -m venv venv
21     . ./venv/bin/activate
22
23 Install necesary dependencies:
24
25         pip install -r requirements.txt
26
27 Modify conf.py as needed:
28
29         vi conf.py
30
31 Run simulation (use the -h flag to see more options):
32
33         python3 model.py
34
35 Results are stored in ./out/.